Clínica La Estancia ha desarrollado un modelo de atención intercultural desde 2020, con el objetivo de brindar un enfoque diferencial hacia la población indígena en el Cauca. Este modelo se ha convertido en referencia a nivel nacional y cuenta con un Pabellón Intercultural equipado con 43 camas.

Además, se ha creado un espacio dedicado a la medicina ancestral, donde se encuentra una huerta con plantas medicinales y una cocina para preparar alimentos tradicionales. También se destaca la presencia de la Tulpa, un lugar sagrado para estas comunidades

Así mismo, Clínica La Estancia ha invertido en la atención del parto de madres indígenas, contando con tres camas especiales que se adaptan a los procesos de alumbramiento tradicionales (TPR). Estas camas están equipadas con soportes en el techo para el uso del chumbe, un elemento utilizado por las mamitas indigenas para aliviar el dolor durante el parto.